有分析人士认为，对于中小企业来说，要想进入B2B电子商务平台，仍然存在不少问题，这些问题成为中小企业进入B2B电子商务的障碍，使得它们犹疑不决，难以下定决心去开展B2B电子商务业务。而这些问题中，来自商业环境的问题使得中小企业对电子商务缺乏信心，阻碍了电子商务的发展。
　　业内人士认为，虽然目前国内电子商务正在飞速发展中，但是仍然还处于电子商务的初级发展阶段，中小型企业开展电子商务还缺乏一个成熟的商业环境。
　　作为一种新兴的商业交易方式，目前中国在电子商务方面的法律法规还很不健全，一旦在电子商务交易中产生问题，难以得到法律的保障。而电子商务的特殊性，使得交易中出现问题的可能性比传统商务大得多，交易的双方都会担心在这一过程中受到欺诈或损害。而法制的不健全，更是让交易的双方觉得缺少利益保障，对电子商务这种商务模式缺乏信心。
　　另外，电子商务主要是通过互联网来进行的，而网络安全的复杂性更是给电子商务带来极大的挑战。如今网络病毒、黑客攻击、网络欺诈等，来自网络的威胁层出不穷。如何保障网银资金的安全、支付过程中的安全，甚至电子商务网站本身的安全等，都是不得不考虑的问题。
　　分析人士认为，中小企业电子商务本身也存在不少问题，其中既有管理的问题，也有人才、资金等瓶颈亟待突破。
　　许多中小企业管理基础落后，领导信息化意识不强，也没有充分认识到知识经济时代抢占信息市场的重要性。一般对于中小企业来说，企业的一把手决定整个企业的业务方向，如果中小企业管理者对于电子商务认识不够，或者对如何开展电子商务理解比较欠缺，对电子商务不是很重视，那该企业的电子商务也就很难开展得好。
　　中小企业使用互联网和参与电子商务的程度参差不齐，目前很多中小企业仍缺乏必要的信息化体系。由于资源有限，许多中小企业需要把主要精力集中放在业务上，难以投入足够的资源进行信息化建设。缺少必要的信息化资源，中小企业就难以对采购、生产、库存、销售、财务和人事等方面进行统一控制，难以开展电子商务业务。
　　另外，中小型企业开展电子商务既需要技术又需要人才，但大多数中小企业往往缺少电子商务人才。此外，资金短缺是中小企业的普遍困难，而很多中小企业对于电子商务重要性认识不够，在电子商务方面投入的资金十分薄弱，投入资金的不足往往使得中小企业电子商务并不能带来多少效果，这使得企业的投资回报率低，难以获得持久的发展动力。
　　分析人士认为，电子商务在我国的发展时间并不长，中小企业对实施电子商务发展战略方面还缺乏深刻的认识，但是，在势不可挡的电子商务发展大潮面前，中小企业除了尽早实施电子商务以外，别无选择。否则，就要被电子商务潮流所淘汰。